【文献读图】一文看懂热图!(附详细案例)
①分组说明。
②色阶变化指示表达量高低。蓝色表示低值,红色表示高值。
③基因名:同一行代表该基因在不同组中的表达,可用✳标注出重点关注的基因。
④样本:每一列代表一个样本,上面一排的蓝色表示样本不存在K700E突变,红色则表示存在突变;下面一排的绿色表示野生组(WT组),橙色表示突变组(MUT组);同时对样本进行了聚类。
⑤对不同的基因进行聚类。
⑥一个色块代表一个数值,颜色越红则表达量越高,颜色越蓝则表达量越低。
案例解读
该热图展示了此前GO富集分析的80个基因子集的表达变化,样本(WT组与MUT组)的变量是K700E是否突变。星号标注的是受1~8个差异剪接事件影响的基因。
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热图相关的衍生图有哪些?
①聚类热图:常用于展示基因表达、蛋白质相互作用、代谢途径活性等方面的数据信息。
②相关性热图:用于多组学关联分析,同时展现组间/组内的相关性分析结果。
③组合热图:多种图形组合而成的热图,用于同时展示变量在某指标的大小及变化趋势。
④方格热图:可用于展示行列两两之间的互作关系,例如基因(配体受体)之间的互作关系。
⑤环形热图:将环形热图与环形聚类树结合,可用于清晰展示不同分组基因的表达数据。
⑥3D热图:通过色彩空间来展示表达量数值的高低变化。
⑦富集分析热图:可用于展示所选基因和通路之间的关系以及基因的表达倍数变化。
⑧分类数据热图:用于展示连续型数据的变化,例如基因的表达量。
⑨个性标签热图:当基因数量过大时,热图中的基因标签会重叠到一起而无法识别,该热图则可用于选择性展示部分基因。
⑩电泳凝胶热图:展示离散型数据的变化规律,例如基因的上调表达、下调表达。
以上就是今天的所有内容啦,继续期待下期【文献读图】的精彩内容吧~
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